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DAP-seq助力揭示蘋果MYB54轉錄因子調控細胞壁防御機制

更新時間:2025-01-15   點擊次數(shù):1050次

2024年12月11日,西北農(nóng)林科技大學馬鋒旺-李超團隊在The Plant Journal期刊(IF=6.2)發(fā)表了題為“MdMYB54 reduces disease severity caused by Fusarium solani in apple by modulating cell wall cellulose and pectate lyase-dependent defense"的研究論文,該文章借助DAP-seq技術,揭示了蘋果MYB54轉錄因子通過調節(jié)細胞壁纖維素和果膠裂解酶依賴的防御機制以減輕病害。

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研究背景

蘋果是四大水果之一,但是蘋果種植面臨再植病 (ARD)問題,影響植株生長、果實品質和產(chǎn)量,這主要由尖孢鐮刀菌(Fusarium solani)引起。植物進化出復雜遺傳調控因子來抵抗生物和非生物脅迫,MYB 轉錄因子家族廣泛參與植物脅迫響應,但在蘋果抗F. solani中的作用及機制尚不清楚。植物細胞壁是抵御病原體入侵的第一道屏障,纖維素含量增加有助于增強植物抗病性,果膠裂解酶可觸發(fā)細胞壁防御反應,但 MYB 轉錄因子如何通過誘導細胞壁防御反應抵抗F. solani仍有待探索。

研究結果

前期研究結果表明,MdERF114通過調控MdPRX63的轉錄顯著增強了蘋果根部對尖孢鐮刀菌的抗性。作者通過Y2H(酵母雙雜交系統(tǒng))篩到與MdERF114的互作蛋白MdMYB54,并通過pull-down、Y2H、熒光素酶互補(Split-LUC)實驗證實MdMYB54與MdERF114在體外和體內(nèi)均直接相互作用。MdMYB54定位于細胞核,其啟動子中存在多個與脅迫和激素響應相關的順式作用元件。且受F. solani、水楊酸(SA)和茉莉酸(JA)誘導,在蘋果根中高表達。

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圖1 MdMYB54與MdERF114相互作用


為研究MdMYB54基因在蘋果根對F. solani的作用,作者構建了MdMYB54-OE和MdMYB54-RNAi材料。 MdMYB54-OE增強了蘋果根對F. solani的抗性,表現(xiàn)為植株生長受抑制程度減輕、根相對電導率(REL)和丙二醛(MDA)含量降低、根活性提高、根部病斑數(shù)量和面積減少;RNAi株系則表現(xiàn)出相反結果。

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圖2 MdMYB54正向調控蘋果植株對Fusarium solani的抗性


使用DAP-seq技術檢測MYB54在全基因組水平上的結合位點。22%的結合位點位于基因啟動子區(qū),36%位于遠端基因間區(qū),10%位于基因下游區(qū)域,6%位于于外顯子區(qū)。通過Meme分析發(fā)現(xiàn)兩個高度富集的MdMYB54結合位點。DAP-qPCR結果顯示,MdCesA6MdPLL8MdPLL12的啟動子區(qū)與對照相比,富集倍數(shù)顯著增加。KEGG通路富集分析顯示,MdMYB54靶基因參戊糖和葡萄糖醛酸相互轉化、MAPK信號通路、植物激素信號轉導和植物-病原體相互作用通路中顯著富集。GO分析發(fā)現(xiàn),靶基因在乙烯、水楊酸和缺水響應等分子功能上顯著富集,說明MdMYB54可能與脅迫響應、植物生長發(fā)育有關。

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圖3 MdMYB54靶基因的鑒定


電泳遷移率測定(EMSA)和酵母單雜交(Y1H)實驗結果顯示,MdMYB54在體內(nèi)外直接與MdCesA6MdPLL8MdPLL12的啟動子結合。雙熒光素酶(Dual-Luc)和葡萄糖醛酸酶(GUS)實驗顯示,MdMYB54激活了這些基因的表達。

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圖4 MdMYB54對MdCesA6MdPLL8MdPLL12的轉錄激活作用

F. solani處理下,MdMYB54過表達根系纖維素含量和果膠裂解酶活性顯著高于野生型植株,而在MdMYB54-RNAi根系中則相反。

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圖5 纖維素含量和果膠裂解酶活性的測定


為了進一步研究MdCesA6MdPLL8MdPLL12F. solani感染中的作用,作者構建了MdCesA6-OE,MdPLL8-OE,和MdPLL12-OE材料。發(fā)現(xiàn)過表達MdCesA6MdPLL8MdPLL12增強了蘋果根對F. solani的抗性,表現(xiàn)為植株生長改善、根損傷減輕、REL和MDA含量降低、根活性提高。

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圖6 MdCesA6MdPLL8MdPLL12過表達增強了蘋果對F. solani的抗性


為研究MdERF114和MdMYB54的相互作用是否影響MdMYB54對MdCesA6MdPLL8MdPLL12的調控,作者進行了GUS、雙熒光素酶測定實驗。結果表明,MdERF114和MdMYB54之間的相互作用促進MdMYB54激活MdCesA6MdPLL8MdPLL12啟動子的激活,增強蘋果對F. solani的抗性。

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圖7 MdERF114促進了MdMYB54與MdCesA6MdPLL8MdPLL12啟動子的結合

實驗結論

MdMYB54 是蘋果中抵抗F. solani的正調控因子,與MdERF114相互作用,通過直接結合并激活細胞壁相關基因MdCesA6MdPLL8MdPLL12的啟動子,增強纖維素沉積和果膠裂解酶活性,提高蘋果對F. solani的抗性。研究揭示了MdMYB54在F. solani感染蘋果根中的調控機制,為理解其在緩解蘋果再植病挑戰(zhàn)中的作用提供了依據(jù),為提高蘋果產(chǎn)量和品質、培育優(yōu)良砧木新品種奠定了理論基礎。





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